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WEB用の画像形式と同じく普段当たり前に使っていても意外と知らない事も多かったです。
詳しくは以下
■Adobe Photoshop .psd
Adobe Photoshopのネイティブ形式。Indesign上で配置すると、レイヤーやチャンネル、パスなどを保持したまま配置できます。画像データが重いのが難点。配置はプレビュー画像ではなく実画が表示されるため写真が多い制作物だとマシンパワーが必要となります。
■Photoshop EPS .eps
DTPでは最も標準的なファイル形式で、Postscript言語を基準にしています。ベクトルグラフィックとビットマップ画像の両方を含めることができるので、パスデータをクリッピングパスとして保存し、切り抜き画像を作成することも可能。プレビュー画像を保存時に含めて、レイアウト上ではプレビューを表示させることでソフトの負担を減らすことができます。保存時にJPEG圧縮エンコーディングをかけることができ、ファイルの重さもかなり軽減できます。
■TIFF .tif
TIFF形式は、ほとんど全てのペイント、画像編集、ページレイアウトソフトでサポートされているビットマップ画像形式です。そのためTIFFデータで上げてくる写真家の方も多い。その他にTIFFは二階調画像として保存すればレイアウトソフト上で色を付ける事もできます。
■PDF .pdf
PDF（Adobe Acrobat Portable Document Fomat）は、レイアウトされた完全なドキュメントを配布及び表示するための標準的な形式です。Postscript3を基にしているので、 Postscriptに非常に親和性があります。最近はPDFで入稿できる所も増えてきて、DTPでも非常に重要な圧縮形式の一つ、レイアウト、タイポグラフィ、ビットマップ画像、ベクトルグラフィックを保持でき、フォントデータも埋め込めます。入稿や印刷だけでなく様々な圧縮サイズを選べるため、確認用としても重宝します。
■Photoshop DCS .eps
DCSはDesktop Color Separationsの略で、Quark社によって開発されたEPS形式の一つです。ファイルは、単一のファイルと、複数の特色チャンネルによってできており、例えば１つのCMYKファイルを保存すると、プレビュー用のファイルと、CMYKに分けられた４つのファイル、計５つのファイルが作成できます。仕事や環境にもよりますが、あまり一般的ではなく、現場ではほとんど使われていません。
画像の保存形式は多岐にわたりますが、最終入稿する印刷所にもよりますし、どれを使用するかは社内のRIP環境にもよりますので一概にどれが良いとは言えませんが、EPSバイナリにしておけば大抵の問題は解決してくれるでしょう。
追記：5/28
お恥ずかしいことに、認識不足、知識不足な点が上記には多々あります。M.C.P.Cさんで「「DTPで使う画像形式の違い」について指摘」というエントリーで色々とご指摘いただいています。またはてブで以下のようなご指摘をいただきました。しばらく徹底的に調べてみて、修正版をアップしたいと思います。誤解を与えてしまった方申し訳ないです。
配置用と出力用でちゃんぽん解説になっているところが残念。DTP用ならDTP専属の人のページを参照すべき、と言いたいところだが該当するページがないｗ。あと、s/indesign/inDesign/、s/Postscript/PostScript/ 用語大事。
via イメージ画像
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ちなみにPhotoshop DCSはDCS2.0は単一のファイルとしても保存することができます。